Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms