Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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