Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms