Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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