Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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