Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms