Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms