Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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