Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms