Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms