Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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