Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms