Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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