Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm3238W4VSP7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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