Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm3550W4VSN7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms