Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms