Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms