Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn9Q9Z0S7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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