Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms