Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NrkQ9R0G8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NrkQ9R0G8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms