Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clcf1Q9QZM3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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