Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms