Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms