Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt3Q9QZ47 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms