Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms