Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tomm40Q9QYA2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tomm40Q9QYA2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tomm40Q9QYA2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms