Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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