Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms