Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms