Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms