Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod4Q9JLH8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms