Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms