Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hmgn5Q9JL35 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hmgn5Q9JL35 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hmgn5Q9JL35 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms