Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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Chrac1Q9JKP8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chrac1Q9JKP8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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