Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms