Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms