Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sv2aQ9JIS5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms