Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl28Q9JIL2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms