Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ClpxQ9JHS4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ClpxQ9JHS4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms