Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms