Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim39Q9ESN2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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