Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms