Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r53Q9EP93 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r53Q9EP93 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms