Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms