Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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