Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Riok3Q9DBU3 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Riok3Q9DBU3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms