Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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