Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Smg9Q9DB90 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Smg9Q9DB90 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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