Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnpy3Q9DAU1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms