Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem239Q9DA47 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Tmem239Q9DA47 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem239Q9DA47 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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